### **Long-term Sampling of Threespine Stickleback from the Lakes of Haida Gwaii** ### Français ci-dessous **Collaborating Researcher(s) and Agency:** - Project partner: Prof. Andrew Hendry, Redpath Museum and Departent of Biology, McGill University - Principal data owner: Prof. Tom Reimchen, Department of Biology, University of Victoria **Description of Project:** For more than five decades, Dr. Thomas Reimchen has conducted extensive research on the threespine stickleback (*Gasterosteus aculeatus*) resident in the lakes of Haida Gwaii, a culturally- and ecologically-significant archipelago off the coast of British Columbia. Threespine stickleback are an important model system in (eco-)evolutionary biology and, while the species has a Holarctic distribution, those found on Haida Gwaii are thought to be particularly distinct and diverse given the islands' history as a glacial refugium. The long-term and extensive nature of the sampling make this dataset rather unique and of high preservation value. In light of Dr. Reimchen's impending retirement, the trove of specimens and data will gradually be transferred to the Redpath Museum at McGill University, where they will be housed in perpetuity. The dataset is a series of collections spanning from 1969 to 2020. The collections come from more than 140 locations (lakes and streams) across the archipelago, including repeated annual sampling from Drizzle Lake (35 years) and Boulton Lake (20 years). The dataset consists, first and foremost, of the actual physical specimens and their associated metadata. In addition to these samples, the data include measurements of individual morphology, diet (stomach contents and stable isotopes), contaminants (plastics, metals, pollutants), and DNA samples, as well as biophysical data from all lakes. The total collection includes some 1,200 sampling events and around 55,000 individual stickleback. This first internship will include handling and cataloging of specimens at the University of Victoria (including the development of a system for uniquely identifying and tracking samples), and organization of specimen transfers to Redpath Museum. Other internship activities will include the review and prioritization of data for archiving (in close consultation with Dr. Reimchen), collation and cleaning of the lake biophysical data, and curation and documentation of the metadata and collection methods associated with the physical specimens. All metadata will be uploaded to Redpath Museum's publicly-accessible collections database, where they can be queried and loaned by researchers. The intern will work to develop a data management plan for subsequent phases of data archiving, with the ultimate goal of having all data and associated metadata permanently posted to an open access repository. **Remuneration:** As with all Living Data Project internships, a fellowship of $6500 is provided for 6 weeks of full-time internship (or the equivalent part-time work spread over a longer time period). This fellowship is intended to contribute to the annual stipend of the graduate student, and is inclusive of any benefits or costs. **Internship date:** `Start: anytime between 01 October and 01 December 2021` `End: latest by 28 February 2022` **Internship location:** Combined virtual and in-person** ** This internship requires the graduate student to be in residence at the University of Victoria for at least 6 weeks. This period is necessary to work with, organize, and process the physical specimens and their metadata, and supervise transfer to Redpath Museum in Montreal. The intern will subsequently be based at Redpath Museum. **Other potential benefits to intern:** This data rescue internship partially fulfills the requirements of the CIEE Certificate in Data Management and Reproducible Research (see https://www.ciee-icee.ca/data.html). The intern will also gain valuable experience working with physical specimens and coordinating specimen and data transfers with a museum. Depending on the interests of the intern, there are also opportunities to work with part(s) of the data to address new research questions. Additionally, the intern will be encouraged to contribute to the preparation of a museum exhibit featuring the collection and/or other public outreach materials. **Candidates are urged to consider how they might incorporate these collections in their own graduate work.** **Qualifications required:** The candidate must be a registered graduate student at one of the following four universities: McGill University, University of British Columbia (Vancouver or Okanagan), Université de Montréal, and University of Regina. The candidates major area of research must be one of ecology, evolution, or environmental sciences, and the candidate must demonstrate that they have the conceptual training necessary to evaluate the ecological value of the data that they may encounter in this project. The candidate must be able to create computer scripts to manage digital data, including data validation, compilation, and quality control, and have the relevant scientific expertise to create useful metadata. **Applicants should have a basic understanding of GIS concepts and familiarity with geospatial software (e.g., ArcMap) -- training will also be provided**. **Candidates with previous research experience on threespine stickleback are strongly encouraged to apply.** The candidate should be enthusiastic about preserving legacy data and demonstrate a commitment to open science. **Qualifications desired:** The ideal candidate will have research interests in evolutionary biology, population ecology, fisheries, and/or marine/aquatic ecology. The candidate will ideally have completed or plan to register in the Living Data Project's modules on Productivity and Reproducibility ([course outline](https://osf.io/uwzx5/wiki/1.%20Course%20outline%20and%20schedule/)) and Scientific Data Management ([course outline](https://osf.io/sjf2g/wiki/Course%20outline/)). We will also consider equivalent training or demonstration of skills. **French language skills are an asset.** **Application:** Please fill in the [application form](https://ubc.ca1.qualtrics.com/jfe/form/SV_6JaQeR9z5804ODI) by `18 July 2021`. ----- ### **Échantillonnage à long terme d'épinoches à trois épines dans les lacs de Haida Gwaii** ### **Chercheurs collaborant et organisation:** - Partenaire du projet : Pr Andrew Hendry, Musée Redpath et Département de biologie, Université McGill - Propriétaire principal des données : Pr Tom Reimchen, Département de biologie, University of Victoria **Description du projet:** Pendant plus de cinq décennies, le professeur Thomas Reimchen a mené des recherches approfondies sur l’épinoche à trois épines (*Gasterosteus aculeatus*) des lacs de Haida Gwaii, un archipel d'importance culturelle et écologique situé au large de la côte de la Colombie-Britannique. L'épinoche à trois épines est une espèce modèle importante en biologie (éco)évolutive et, bien que l'espèce a une distribution holarctique, on pense que les poissons trouvés sur Haida Gwaii sont particulièrement distincts et diversifiés compte tenu de l'histoire de refuge glaciaire des îles. La longévité et l’étendue de l'échantillonnage rendent cet ensemble de données plutôt unique et d'une grande valeur scientifique. La retraite du professeur Reimchen étant imminente, le trésor de spécimens et de données qu’il a cumulé sera graduellement transféré au Musée Redpath de l'Université McGill où il sera conservé de manière pérenne. L'ensemble de données est constitué d’une série de collections couvrant de 1969 à 2020. Celles-ci proviennent de plus de 140 emplacements (lacs et ruisseaux) à travers l'archipel, y compris les échantillonnages annuels du lac Drizzle (35 ans) et du lac Boulton (20 ans). L'ensemble de données se compose, d'abord et avant tout, des spécimens physiques réels et de leurs métadonnées associées. En plus de ces échantillons, les données comprennent des mesures de la morphologie individuelle, du régime alimentaire (contenu gastrique et isotopes stables), des contaminants (plastiques, métaux, polluants) et des échantillons d'ADN, ainsi que des données biophysiques pour tous les lacs. La collection totale comprend quelque 1 200 campagnes d'échantillonnage et environ 55 000 spécimens d’épinoches. Ce premier stage comprendra la manipulation et le catalogage des spécimens à l'University of Victoria (comprenant le développement d'un système unique d'identification et de suivi des échantillons) et l'organisation des transferts de spécimens au Musée Redpath. Les autres activités de stage comprendront l'examen et la hiérarchisation des données pour l'archivage (en étroite collaboration avec le professeur Reimchen), la collecte et le nettoyage des données biophysiques du lac, ainsi que la conservation et la documentation des métadonnées et des méthodes de collecte associées aux spécimens physiques. Toutes les métadonnées seront téléchargées dans la base de données des collections accessible au public du Musée Redpath, où elles pourront être consultées et empruntées par les chercheurs et chercheuses. Le ou la stagiaire travaillera aussi à l'élaboration d'un plan de gestion des données pour les phases ultérieures de l'archivage des données, dans le but ultime d'afficher en permanence toutes les données et métadonnées associées dans un référentiel en libre accès. **Rémunération :** Comme pour tous les stages du Projet Living Data, une bourse de 6500 $ est fournie pour 6 semaines de stage à temps plein (ou l'équivalent réparti sur une période plus longue). Cette bourse vise à contribuer aux revenus de l'étudiant ou de l’étudiante aux cycles supérieurs et inclut tous les avantages ou couts. **Date du stage:** `Début : entre le 1er octobre et le 1er décembre 2021` `Fin : au plus tard le 28 février 2022` **Lieu du stage:** À la fois virtuel et en personne** ** Ce stage exige que la ou le stagiaire se situe à l'University of Victoria pendant au moins 6 semaines. Cette période est nécessaire pour organiser et traiter les spécimens physiques et leurs métadonnées, ainsi que pour superviser le transfert au Musée Redpath à Montréal. Le ou la stagiaire sera par la suite basé-e au Musée Redpath. **Autres avantages potentiels du stage:** Ce stage de sauvetage de données répond en partie aux exigences du certificat de l’ICEE en gestion des données et recherche reproductible (voir https://www.francais.ciee-icee.ca/donneacutees.html). Le ou la stagiaire acquerra également une expérience précieuse en travaillant avec des spécimens physiques et en coordonnant les transferts de spécimens et de données avec un musée. Selon les intérêts de la personne stagiaire, il sera également possible de travailler avec une ou plusieurs parties des données pour répondre à de nouvelles questions de recherche. De plus, le ou la stagiaire pourra contribuer à la préparation d'une exposition muséale présentant la collection ou d'autres documents de sensibilisation du public. **Les personnes candidates sont vivement invitées à réfléchir à la manière dont elles pourraient intégrer ces collections dans leurs propres travaux d'études supérieures**. **Qualifications requises:** La personne candidate doit étudier aux cycles supérieurs dans l'une des quatre universités suivantes : l'Université McGill, l’University of British Columbia (Vancouver ou Okanagan), l'Université de Montréal ou l'University of Regina. Son principal domaine de recherche doit être en écologie, en évolution ou en sciences de l'environnement, et elle doit démontrer qu'elle possède la formation conceptuelle nécessaire pour évaluer la valeur écologique des données du projet. La personne candidate doit être capable de créer des scripts informatiques pour gérer des données numériques, les valider, les compiler et contrôler leur qualité. La personne candidate doit aussi posséder l'expertise scientifique pertinente à la création de métadonnées utiles. **Les candidats et candidates doivent avoir une compréhension de base des concepts SIG et une certaine connaissance des logiciels géospatiaux (par exemple, ArcMap) – de la formation sera également fournie. Les personnes candidates ayant une expérience de recherche antérieure sur l'épinoche à trois épines sont fortement encouragées à postuler**. Le ou la candidate doit être enthousiaste à l'idée de préserver des données historiques et démontrer son engagement envers la science ouverte. **Qualifications recherchées:** Le ou la candidate idéale a des intérêts de recherche en biologie de l’évolution, en écologie des populations, en pêcheries ou en écologie aquatique. Le ou la candidate aura idéalement effectué les modules du Projet Living Data sur la productivité et la reproductibilité ([plan de cours](https://osf.io/uwzx5/wiki/1.%20Course%20outline%20and%20schedule/) – en anglais) et la gestion des données scientifiques ([plan de cours](https://osf.io/sjf2g/wiki/Course%20outline/) – en anglais) ou aura amorcé les procédures d’inscription à ces modules. Une formation équivalente ou une démonstration de compétences seront aussi considérées. **La maîtrise de la langue française est un atout**. **Dépôt de candidature:** Veuillez remplir le [formulaire de candidature](https://ubc.ca1.qualtrics.com/jfe/form/SV_6JaQeR9z5804ODI) d'ici le `18 juillet 2021.`