*Français ci-dessous*
# Georeferencing time series of Canadian vertebrates in the Living Planet Database
**Collaborating Researcher(s) and Agency:**
- Valentina Marconi, Postgraduate Research Assistant, Indicators and Assessments Unit, Institute of Zoology
- Louise McRae, Research Associate, Indicators and Assessments Unit, Institute of Zoology
- Stefanie Deinet, Postgraduate Research Assistant, Indicators and Assessments Unit, Institute of Zoology
**Description of Project:**
Understanding the pressures and threats facing populations is critical for understanding why some wildlife populations are in decline. The Living Planet Database (LPD) is a rich source of data on Canadian wildlife, with over 6,000 abundance time-series for more than 900 Canadian vertebrate species covering the period 1950-2022. The data in the LPD have been used to understand dynamic processes in ecology, for example to investigate the drivers of population trends in Canada, to quantify species' resilience, to analyse the effectiveness of protected areas, and more.
However, accurate information on the spatial extent of populations within the LPD is currently missing. Being able to improve the Canadian dataset by adding detailed spatial information to the time-series would allow for further exploration of these scientific questions. We are seeking an intern to test the protocol developed by previous Data Rescue interns. This protocol extracts geospatial data and stores the information as polygon data in the LPD. The final dataset with associated geospatial data compiled by the intern will be archived on a public repository and submitted for publication to a peer-reviewed, open-access journal as a data paper to reach conservation practitioners and policymakers.
**Remuneration:**
As with all Living Data Project internships, a fellowship of $6500 is provided for 6 weeks of full-time internship (or the equivalent part-time work spread over a longer time period; 240 hours total). This fellowship is intended to contribute to the annual stipend of the graduate student, and is inclusive of any benefits or costs.
**Internship date:**
`Start: anytime between 01 Nov and 01 Dec 2023`
`End: latest by 29 Feb 2024`
**Internship location:**
100 % remote
**Other potential benefits to intern:**
This data rescue internship partially fulfills the requirements of the CIEE Certificate in Data Management and Reproducible Research (see https://www.ciee-icee.ca/ldp-certificates.html). **The intern will be invited to be a co-author on the manuscript and to contribute to all stages of its development.**
**Qualifications required:**
The candidate must be a registered graduate student at one of the following four universities:
- McGill University
- University of British Columbia (Vancouver or
Okanagan)
- Université de Montréal
- University of Regina
The candidate's major area of research must be one of ecology, evolution, or environmental sciences, and the candidate must demonstrate that they have the conceptual training necessary to evaluate the ecological value of the data that they may encounter in this project. The candidate must be able to create computer scripts to manage digital data, including data validation, compilation, and quality control, and have the relevant scientific expertise to create useful metadata. The candidate must have an attention to detail, the ability to document steps, and work collaboratively. The candidate should be enthusiastic about preserving legacy data, and demonstrate a commitment to open science.
**Qualifications desired:**
The candidate will ideally have completed or plan to register in the Living Data Project's modules on Productivity and Reproducibility ([course outline](https://osf.io/8ycvj/wiki/home/)) and Scientific Data Management ([course outline](https://osf.io/jwaps/wiki/home/)). We will also consider equivalent training or demonstration of skills. **The ideal candidate will be well-versed in using geospatial software (e.g., ArcGIS or R spatial packages) for georeferencing. A basic to intermediate familiarity or experience with using relational databases (e.g., MySQL) may be an asset.**
Please fill in the [application form](https://ubc.ca1.qualtrics.com/jfe/form/SV_7OJcD2fCW23Il3E) by `20 June 2023`.
# Séries chronologiques de géoréférencement des vertébrés canadiens dans la base de données Planète vivante
**Chercheuses collaborant et organisation :**
- Valentina Marconi, Assistante de recherche de troisième cycle, Unité des indicateurs et des évaluations, Institute of Zoology
- Louise McRae, Chercheuse associée, Unité des indicateurs et des évaluations, Institute of Zoology
- Stefanie Deinet, Assistante de recherche de troisième cycle, Unité des indicateurs et des évaluations, Institute of Zoology
**Description du projet :**
Comprendre les pressions et les menaces auxquelles sont confrontées les populations est essentiel pour saisir pourquoi certaines populations d’animaux sauvages sont en déclin. La Living Planet Database (LPD) est une riche source de données sur la faune canadienne, avec plus de 6 000 séries chronologiques d’abondances pour plus de 900 espèces de vertébrés canadiens couvrant la période 1950-2022. Les données de la LPD ont été utilisées pour comprendre les processus dynamiques en écologie : pour étudier les moteurs des tendances démographiques au Canada, pour quantifier la résilience des espèces, pour analyser l’efficacité des aires protégées, et plus encore.
Cependant, des informations précises sur l’étendue spatiale des populations font actuellement défaut au sein de la LPD. Être en mesure d’améliorer l’ensemble de données en ajoutant des informations spatiales détaillées à la série chronologique permettrait d’approfondir l’exploration des questions scientifiques. Nous recherchons un ou une stagiaire pour tester le protocole développé lors du précédent stage de sauvetage de données. Ce protocole extrait des données géospatiales et stocke les informations sous forme de données polygonales dans la LPD. L’ensemble de données final avec les données géospatiales associées compilées par le ou la stagiaire sera archivé dans un référentiel public et soumis pour publication à une revue à comité de lecture en libre accès en tant que document de données afin d’atteindre les praticiens et praticiennes de la conservation, ainsi que les décideurs et décideuses.
**Rémunération :**
Comme pour tous les stages du projet Living Data, une bourse de 6500 $ est fournie pour 6 semaines de stage à temps plein (ou l’équivalent réparti sur une période plus longue, soit 240 heures au total). Cette bourse vise à contribuer aux revenus de l’étudiant ou de l’étudiante aux cycles supérieurs et inclut tous les avantages ou couts.
**Date du stage :**
`Début : entre le 1er novembre et le 1er décembre 2023`
`Fin : au plus tard le 29 février 2024`
**Lieu du stage :**
100 % à distance
**Autres avantages potentiels du stage :**
Ce stage de sauvetage de données répond en partie aux exigences du certificat de l’ICEE en gestion des données et recherche reproductible (voir [https://www.ciee-icee.ca/ldp-certificates-444444.html](https://www.ciee-icee.ca/ldp-certificates-444444.html)). De plus, la personne stagiaire sera invitée à être co-autrice du manuscrit et à contribuer à toutes les étapes de son élaboration.
**Compétences requises :**
La personne candidate doit étudier aux cycles supérieurs dans l’une des quatre universités suivantes :
- Université McGill,
- University of British Columbia (Vancouver ou Okanagan),
- Université de Montréal,
- University of Regina.
Son principal domaine de recherche doit être en écologie, en évolution ou en sciences de l’environnement, et elle doit démontrer qu’elle possède la formation conceptuelle nécessaire pour évaluer la valeur écologique des données du projet. La personne candidate doit être capable de créer des scripts informatiques pour gérer des données numériques, les valider, les compiler et contrôler leur qualité. La personne candidate doit aussi posséder l’expertise scientifique pertinente à la création de métadonnées utiles. Le ou la candidate doit être enthousiaste à l’idée de préserver des données historiques et démontrer son engagement envers la science ouverte.
**Compétences recherchées :**
Le ou la candidat.e idéal.e aura de solides compétences en informatique et de l’expérience en gestion de bases de données. Le ou la candidate aura idéalement effectué les modules du projet Living Data sur la productivité et la reproductibilité ([plan de cours](https://osf.io/8ycvj/wiki/home/) – en anglais) et la gestion des données scientifiques ([plan de cours](https://osf.io/jwaps/wiki/home/) – en anglais) ou aura démarré les procédures d’inscription à ces modules. Une formation équivalente ou une démonstration de compétences seront aussi considérées. **Le ou la candidate idéale connaitra bien l’utilisation de logiciels géospatiaux (par exemple, les progiciels spatiaux ArcGIS ou R) pour le géoréférencement. Une connaissance ou une expérience de base à intermédiaire dans l’utilisation de bases de données relationnelles (par exemple, MySQL) peut être un atout.**
Veuillez remplir le [formulaire de candidature](https://ubc.ca1.qualtrics.com/jfe/form/SV_dclRicXIC0TPuyG) d’ici le `20 juin 2023.`